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選拔為改良遺傳性能的方法，它決定何者被留作種用、動物要繁殖多少後裔以及要留在畜群多久。 選拔的方法有很多種，其中表現型選拔被視為最簡單的方式，只需參考每個候選動物的性能即可，其祖先系譜或兄弟姊妹、後代性能一概不列入考量。 例如， 原住民可將生長較慢、體型較小的水牛優先淘汰，只留下體型較大、較強健的水牛，並經由選型配種的方式，將相似體型的水牛相互交配，產下體型較大又較強健的仔牛，來增加仔牛育成率和出售體重，減少飼養者的損失。 雖然依此方式選拔已越來越少被使用，但對於缺少地區資源的原住民族來說，卻是最直接的方式。 冷凍精液技術應用. 冷凍精液技術是現代畜牧業重要的一項技術。 這項技術允許農民和畜牧業者收集、保存和運輸高品質的遺傳物質。
育種的關鍵之一就是選拔，也就是人擇，從外表性狀不一的群體中，挑選自己理想的個體，例如，挑選株高較矮、成熟期較為一致、種子無落粒性、果實較大、產量較高、發芽較整齊、無芒、無毒等，經過數千年至上萬年的選拔，現今很多作物已與其野生祖先在外觀型態差異很大，例如大芻草是玉米的祖先，大芻草有很多莖桿、很長的分支，其穗很小、穀粒很小又硬；稻米的祖先是紅鬚稻，又長又紅的芒、落粒性很強、匍匐延伸性強或分蘗性強；野生番茄的果實又小又酸；野生向日葵有許多小朵的花長在柔弱莖桿等。 玉米與祖先物種大芻草的穀粒大小有巨大落差。 （圖片來源／John Doebley 威斯康辛大學麥迪遜分校名譽教授） 在新石器革命中，人類祖先從自己生活周遭的野生族群馴化動植物，慢慢從游牧生活轉為定居生活，也是農業濫觴之時。
嘉寶西瓜是澎湖特有的西瓜品種，嘉寶西瓜特性，包括果長30～35公分、皮薄、橘黃色果肉、沙沙的口感及種子淡褐色且偏多等。 高改場109年開始進行澎湖地區嘉寶西瓜選育工作，選育目標訂為具橢圓果型、優良口感、橘肉、果皮薄及生長勢強之嘉寶瓜品種。 嘉寶西瓜果長僅30多公分，十分玲瓏可愛。 （攝影／ CyrilChen @flickr CC BY-NC 2.0） 109 年春作，主要利用高改場澎湖分場歷年蒐集的種原及澎湖縣農會提供之 F 2 世代 （按：指雜交體的第二子代），包括CP001-CP030 (F 2) 共30個品系（種）為材料，進行橙色果肉的選拔試驗。 經由自然環境及病蟲害之淘汰，最後選出CP014、CP021、CP024及CP030 等4 個品系供作109 年秋作參試品系。
- 傳統育種
- 分子育種
- 分子標誌輔助育種
現代植物育種可以簡單區分為傳統育種（conventional breeding）和分子育種（molecular breeding），傳統育種的方法有多倍體育種、誘變育種及雜交育種等，創造了現今大部分的栽培品種。 不同品種／系間雜交獲得雜交後代，繼而在雜交後代的分離族群中進行選拔以育成符合生產要求的新品種，稱為雜交育種，這是國內外廣泛應用且有成效的育種方法，透過不同的親本相互雜交而發生基因重組，使後裔產生變異的機會增加，也可從中選出具有優良基因組合的個體，進而培育出新品種。 誘變育種是利用物理、化學或轉基因方式誘發作物產生遺傳變異，依據育種目標，對變異的族群迤行選拔，培育具有價值的新品種，其誘變方式主要分為非基因轉殖的化學誘變劑、物理方法及基因轉殖的TDNA利用與轉位子等方法。然透過不同誘變方...
植物的遺傳物質DNA經由基因的調控丶轉錄丶轉譯等進而影響外表型。藉由以DNA生物技術應用於作物改良是謂「作物分子育種」，主要分為兩大類：第一大類是在傳統的雜交育種中輔以DNA基因型鑑定來選拔子代，此為分子標誌輔助選拔（markerassisted selection, MAS），可以大幅提升選拔效率，縮短育種時程；第二大類則是以遺傳工程組合不同來源的基因，再導入作物基因體，有基因改造或稱基因修飾（genetic modification）技術，將挑選的目標基因連接於載體DNA形成重組DNA，再將此重組DNA轉殖（transformation）入宿主中， 可以達到跨物種間基因平行轉移的基因交流；另一為基因編輯或基因體編輯（gene editing or genome editing）技術，直接...
重要的農藝／園藝性狀大都為數量性狀，如產量、開花、株高及甜度等，受多基因調控和環境的交互影響。由於DNA分子標誌的開發，於傳統的雜交子代中以分子標誌進行基因型分析作為選拔依據，可以不受環境影響精準預測基因型，提升選拔效率，也可在幼苗期篩選基因型，減少於田間試驗的子代數量及人力，更可以在非受試環境下檢測基因型。 目前應用的分子標誌可包含3大類，第一類為限制片段長度多型性（restriction fragment length polymorphism, RFLP），使用限制酶對植物基因體DNA進行切割，可產生各品種的DNA片段長度多型性，以分析品種間的遺傳歧異度；第二類以聚合酶連鎖反應（polymerase chain reaction, PCR）為基礎，較廣為應用的有增幅片段長度多型性（am...
種苗場副研究員張惠如表示，傳統育種需要經過一代一代田間選拔，歷經5至7代才能育成具有目標性狀的單株，種苗場透過分子標誌技術標定所需目標性狀基因，只要3、4代即可篩選出具抗病基因的番茄單株，較傳統育種縮短2、3代，可幫業者加速育成新品種
「早生、耐熱、好吃是臺灣種苗業者已具有的特性，未來希望能提高與加給鬆花系統的競爭力。 」王三太舉例，有無辦法更耐熱，讓花球可在超過攝氏40度的環境下生長，或是更抗病、適合北方寒冷地區栽種等，都是業者可以努力的方向。 臺南場作物改良課助理研究員許涵鈞也補充，日後需要的花椰菜品種不僅要耐熱、耐淹水，對冷也應保持鈍感，因花椰菜遇冷容易提早抽苔開花和變色，不只口感不好，賣相也不佳，太熱又不易結球，造成生長延遲，所以兩者都要兼顧，才有辦法突圍。 標籤. 花椰菜. 種苗. 育種. 鬆花. 慶農種苗公司.
參與式育種主要意旨在於透過農民參與，運用在地知識直接在農民的田進行試驗，選拔適合農田環境的品系，有效產生較多的地方品種，使農田的生物多樣性增加。 藉由參與式育種，可以為不同目標環境選拔特定適應作物性狀，貼近地區農民需求，同時也改善商業品種所導致的生物多樣性偏低狀況。 參與式育種觀念推行以來，全球科學家紛紛投入該領域研究，與區域農民合作開發在地品種，運作多年以來，無論是由育種家主導或由農民主導，在合作規範、分工、責任及利益分配等皆已逐漸建立出一套完整的理論基礎及操作模式。 種子如同國際戰略物資 商業品種更要參與式育種. 參與式育種促進育種家及農民合作，於短期間內改善地方品種，讓作物多樣化、農民留種、農民保種成為可能，同時也保留當地種原，對環境及永續發展助益良多。
