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2018年5月29日 · 吳茂昆曾發現世界第一個高於液態氮溫度的超導體：釔鋇銅氧超導體，被提名諾貝爾物理獎，也曾擔任扁政府任內國科會 (現科技部)副主委。 當時吳茂昆上任僅一周，火速駁回台大校長遴選管中閔案，面對台大未來至少1、2年沒有校長，恐嚴重影響校務運作，他以「那不是教育部的問題」回應。 面對教育部在處理不同大學校長爭議的「差別待遇」，國立大學校院協會呼籲政府還給大學自治、莫干預校長遴選結果，也引發台大「新五四運動」，後續由台大提起的行政訴訟，道路還漫長。 被外界認為是專為拔管而來的吳茂昆，早在上任前，就參與在台大校長案的跨部會諮詢小組中，據聞「拔管」立場堅定。 然則作為教育最高權責機關的負責人，吳茂昆專業上、個人操守的適任與否，不斷成為話題。
2018年4月24日 · 新任教育部長吳茂昆被爆出在擔任東華大學校長任內，到美國設立公司、並掛名負責人，是重大行政瑕疵。 新任教育部長吳茂昆昨（23）日首度到立院備詢，他被立委爆出在東華大學任職期間拿學校專利到美國開設師沛恩生技公司，並將該專利賣到大陸去。 在昨日立院教育委員會上，國民黨立委柯志恩質詢 ，吳茂昆當時身為校長卻在美國設立公司並掛名負責人之一，這可能是重大行政瑕疵，涉及違反「公務人員服務法」第十三條，公務員不得經營商業或投機事業，要求吳茂昆提出完整說明。 吳茂昆答詢時坦承有此事，但稱在美設公司是為了申請專利的「權宜方式」，並不是為了賺錢。 並發新聞稿重申「當時有了專利成果之後，為了要在美國申請所謂的PCT專利合作條約，且不想透過中國申請，所以大家才決定在美國成立一個公司。
2018年4月16日 · 一九八一年，美國休士頓大學物理學博士畢業後，吳茂昆前後在美國哥倫比亞大學、台灣清華大學任教，政務經驗是在前總統陳水扁任內，擔任國科會（現科技部）副主委、主委，曾獲中華民國總統科學獎，美國國家航空暨太空總署傑出貢獻獎，學術聲名遠播。 出身於花蓮的吳茂昆，曾在二O一二年至二O一六年擔任第六屆花蓮東華大學校長。 一四年，他因為對於太陽花學運，公開表態支持大學學術自主，「學生要攻佔校長室也沒問題」，備受關注。 然而同年年末，便爆發有關他任內一連串經費溢領、公共工程延宕、人事黑箱的問題，十二月監察委員王美玉、陳慶財調查並通過彈劾案，認為吳茂昆「疑利用職權使自己獲聘為專任教授，每年加領講座教授獎助金、學術獎勵金並享有一切福利；嗣又修改校內規定，免除自己授課義務，涉有違失」。
2018年5月30日 · 吳茂昆跟管中閔，誰比較高竿？. 教育部長吳茂昆請辭了！. 從他的聲明書內容看起來，非法赴中國開會，是壓死駱駝的最後一根稻草！. 這件事情是怎麼樣呢？. 看下面第一張圖就知道，吳茂昆那個時候要去中國參加兩個會，向行政院申請核准，行政院准 ...
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2018年5月2日 · 記者會一開始，黃光國即批評輔上任的教育部長吳茂昆是一個沒有學術良知、充滿爭議的人。 他認為，用這樣一個人來拔管，本身就是一個很大的侮辱，是對所有教育人員的侮辱，根本是「教壞囝仔大小」。 黃光國不滿地表示，之前台大春節團拜時，三位前校長都出來講話了，結果還是沒有用。 有關管中閔的三大爭議，包括學術倫理爭議、赴中兼課與擔任台灣大哥大獨立董事涉及違法兼職與利益衝突爭議，孫震指出，台大校方及遴選委員會皆已做出完整說明。 他引用總統蔡英文的話，批評教育部跟執政當局是「裝睡的人叫不醒，所有的答案它都聽不懂，悍然不顧，做出一個違背真理、公義、法律的決定。 雖外界紛紛指責管中閔不出來講話，但孫震認為，包括台大校方、遴選委員會、校務會議都出來講話，「裝睡的人都聽不見在作夢，管中閔出來講話不會被抹黑嗎？
2018年4月18日 · 教育部長潘文忠日前辭職，新任教育部長由中研院院士吳茂昆擔任，但由潘文忠擔任教育部長期間所舉辦的全國大專院校運動會（全大會）和全國中等學校運動會（全中會）的5684面獎牌卻全被收回，更改上面落款的教育部長名字。. 全大運 和 全中運 官 ...
