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目前中國等國家使用的禽流感疫苗是死毒疫苗，連一洋說，死毒疫苗存在病毒全組基因，為病毒基因重組變異提供很大的機會，但目前動物疫苗的製作技術已提升很多，動物用載體疫苗已相當商業化，例如，雞隻有一種傳染性華氏囊炎（IBD），其疫苗就是載體疫苗，以馬立克病的疱疹病毒當載體，把可使雞隻產生保護性免疫反應的抗原帶入，即可使雞隻獲得對抗IBD的保護力，這支疫苗已商業化生產，廣泛用於養雞場。 連一洋表示，如果要打禽流感疫苗，現有的死毒疫苗造成病毒基因重組的風險較高，確實有疑慮，且效果似乎有限，因為中國、越南等有打疫苗的國家，還是照樣有禽流感疫情，目前，禽流感的載體疫苗尚未商業化上市，但載體疫苗在動物用疫苗市場已是成熟的技術及商品，研發禽流感的載體疫苗不是難事。
原來光是製造流感疫苗，全球就有上千萬顆的胚胎蛋市場。 這些胚胎蛋必須由無菌科技農場中飼養的雞隻孵化，門檻高、售價也水漲船高。 臺灣生醫業者國光生技近年來逐步拉高在地採購比例，而保富潔淨農場就是去年剛加入的胚胎蛋供應商。
巴斯德在實驗室裡製造實驗疾病後，他立即尋找方法削弱微生物來製造動物用疫苗，並在法國所有畜牧界推廣。 巴斯德的第一件作品是家禽霍亂（fowl cholera）疫苗。 他發現雞隻接觸弱化的細菌後，會對疾病有抵抗性。 隨後於1885年，開發狂犬病（rabies）疫苗，並於1887年創立了巴斯德研究所（Institut Pasteur），成功從動物醫學過渡到人類醫學領域。 不僅衛生學家對巴斯德深信不疑，「巴斯德」一詞在法國人的文化中，已代表現代安全社會的象徵。 而臺灣動物用疫苗研究起因於早期牛瘟疫情，當時牛隻死亡慘重，有關單位於1904年在屏東各地實施牛瘟血清注射試驗，成果頗佳。 1905年於阿猴廳（今為屏東）設立牛瘟血清作業所，是臺灣動物用生物藥品研發、製造機構的開始。
中興大學名譽教授謝快樂指出，禽流感強病毒株每年有變化，不是進口疫苗就可適用國內疫情，且禽流感疫苗只能用死毒疫苗，製作疫苗有效性劑量要達10的8次方，強毒株培養困難，製造疫苗難度高；使用疫苗或許可維持蛋雞生產，具有經濟效益，但蛋雞會排
2024年5月17日 · 防檢署15日啟動彰化、雲林、嘉義、臺南、高雄及屏東等主要酪農縣市轄內各2場乳牛場採集鼻腔及乳汁檢體監控，經獸醫所檢驗，結果今（17）日出爐，均未檢出禽流感病毒核酸。 美國今年3月起於德州等9個州46間乳牛場接連爆發高病原性禽流感H5N1疫情；並在4月1日曾報告1例人類病例，屬輕症，僅有結膜炎症狀，且經流感抗病毒藥物治療已痊癒。 疾管署5月13日召開傳染病防治諮詢會流感防治組會議，邀集跨部會單位，針對國內新型A型流感防治工作進行盤點與討論。 疾管署表示，美國案例是野鳥傳染給乳牛後，再於牛群中傳播；病牛未經消毒的生乳中可檢出大量病毒，其部分市售乳製品中雖檢出病毒殘粒，但均無致病活性，抽驗市售牛絞肉結果也均為陰性。
其實鴨病毒性肝炎、水禽小病毒感染症目前都有商用疫苗，但畜衛所製劑研究組組長曾俊憲表示，現行疫苗是直接施打在種鴨，讓種鴨產下的小鴨帶病毒抗體，但畜主擔憂施打時造成緊迫，種鴨產蛋率下降，因此現在施打率不高。
我國於今（112）年初停止施打羊痘疫苗，並於9月向世界動物衛生組織（WOAH）聲明我國非羊痘疫區。農業部今（21）日召開記者會指出，WOAH已於12月19日正式認可臺灣為非疫區，正式宣告我國撲滅羊痘，代理部長陳駿季表示「農業部內心非常振奮」，希望國人能吃到更多國產羊肉，讓養羊產業變成國人 ...
