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疾管署說明，目前公費流感疫苗4種廠牌皆有到貨量，並按各廠牌採購數量的比例配送至合約院所提供民眾接種，醫院層級並無只剩下高端廠牌之情形
新版NIIS醫療院所預防接種管理子系統之流感疫苗簡易查詢功能. 新版NIIS離線接種軟體.
2021年10月2日 · 新光醫院副院長洪子仁說，為管理疫苗施打對象與疫苗庫存量，流感疫苗必須於施打後隔日中午前，將接種資料上傳至「流感疫苗管理系統」。 今天上午確實接獲同仁回報系統當機，無法上傳。 洪子仁說，院內依照標準流程，先保留接種資料紙本，將等系統恢復後再盡快補登接種數量、批號及施打對象，但他強調，系統當機，並不影響現場接種作業。 「怎麼第1天就當機，很奇怪。 」基層醫療協會理事長、開業診所醫師林應然說，診所收到多少流感疫苗、當天接種多少劑、接種對象身分為何、庫存量剩多少，通常當天會登錄至系統，但昨天開打，資料就無法上傳。 林應然說，往年少有系統當機情況，流感疫苗管理系統當機雖影響不大，資料可再補登，但近期多種疫苗開打接種作業已使醫護人力吃緊，改天還要再派人力補上傳資料。
指揮中心提醒，開打後，民眾可先透過各地方政府衛生局網頁、疾管署流感防治一網通 (https://antiflu.cdc.gov.tw/)、疾管家或1922防疫諮詢專線，查詢鄰近合約院所，再電洽院所預約，以確保可施打到疫苗且節省排隊等候時間；前往接種時應攜帶健保卡及相關證明文件 (如兒童健康手冊、孕婦健康手冊等)，並佩戴口罩、適度保持安全距離及執行手部衛生等措施。
2021年10月2日 · 全台公費流感疫苗10月1日開打，衛福部疾管署「流感疫苗管理系統」首日就傳出大當機災情，讓全國協助接種的上萬個合約接種院所，耗費許多時間仍無法上傳接種數據。 衛福部疾管署昨日證實系統伺服器異常，目前仍在了解問題並搶修中，但民眾個資不受影響。...
