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台灣在2021年5月中旬爆發社區流行後，中央流行疫情指揮中心針對確診病例進行基因定序發現，幾乎所有的個案都是Alpha變異株（又稱B.1.1.7、舊稱英國變種病毒株）。 這隻變種病毒比起疫情初期的武漢病毒株，傳播力增加了6成，在沒有保護措施的狀況下，平均一個人可以將病毒傳染給4個人。 7月，Delta變異株（又稱B.1.617.2，舊稱印度變種病毒株）出現，傳播力更強且很快席捲全球；11月，新的變異株Omicron（又稱B.1.1.529）出現，在12月底就成為新的強勢變種株，2022年9月由Omicron與其亞型BA.5主宰；11月，BA.5變異株受到挑戰，Omicron變異出更多混合亞型，正在爭奪主宰地位，包括X.BB、BA.2.75、BQ.1等。
這一個月來，從境外回國的居家檢疫、密切接觸者匡列的居家隔離，到輕症確診者的居家照護模式，都在隨時調整。 《報導者》採訪專家、整理指揮中心政策，提供民眾最新進度與因應建議。 （最後更新時間：2022年5月31日） COVID-19在全球肆虐2年多來，靠著清零、疫調與嚴守邊境，加上民眾戴口罩的好習慣，讓台灣在今年4月之前僅累積15,973例，一直是全球防疫前段班；如今，病毒經過變種，從Alpha株變成傳染力更強Omicron株為主流，4月疫情大爆發後，截至今日（5月31日），單日新增80,656例，短短一個多月，已累積達201.9萬人確診。 確診人數大增，讓原本耗時、耗人力的精準疫調行政流程完全跟不上病毒傳播的速度，這也意味著過去所有的防疫手段都得「打掉重練」。
2022年1月27日 · 台灣本土的情況也是如此。 根據指揮中心1月28日公布的最新數據，台灣共406例Omicron境外移入，其中超過半數、221人無症狀，另185人輕症、3人中重症。 指揮中心醫療應變組副組長、疾病管制署副署長羅一鈞表示，這三名患者分別為20多歲台灣男性、30多歲外國懷孕女性，以及50多歲台灣男性。 分別出現血氧降低及輕微肺炎、雙側肺炎，以及血氧降低症狀，三人雖在病程裡出現中、重度症狀，但治療改善狀況良好，兩週內就解除隔離，都未進入加護病房。 但也有國家，如丹麥，疫苗接種率86%，Omicron的住院率仍有1.2%，只比Delta株的1.5%略低一些。 馬偕兒童感染科醫師邱南昌認為，國外的狀況值得台灣借鏡，現在Omicron病毒是使COVID-19疫情走向流感化、或是新一波危機？
2022年4月25日 · 2022年4月初，台灣再度爆發COVID-19疫情，傳播力更快的Omicron迅速籠罩全台，單日確診數很快突破2021年5月疫情最高峰值，1,000、5,000、6,000、8,000，屢屢刷新紀錄，國衛院更推估最高可能來到單日4.5萬例確診。
王弘毅. 攝影. 林彥廷. 設計. 黃禹禛 江世民. 從2019年底開始的COVID-19新冠病毒大流行至今（2022年5月），已經感染了超過5億人，並造成超過600萬人死亡。 從最早出現的武漢病毒株之後，這段期間產生了許多的變異病毒株，你可能聽過這些名字，包括：Alpha、Beta、Gamma、Delta、Omicron，甚至Kappa、Mu、Zeta等。 認識4種引發大流行的重要病毒株. 其中，最強勢的有4種病毒株，為全世界帶來了4波流行的高峰： 第一波原始的武漢病毒株： 從2020年初開始全球感染人數逐漸增加，直到2020年底達到該波疫情的頂點，當時全球每日確診病例超過70萬人，直到2021年初病例數才開始下降。
Omicron引起的腦炎，幾乎都發生在10歲以下的兒童，台灣目前少數個案中，有些孩子出現抽搐、癲癇、四肢抖動、眼球上吊，或有幻聽幻覺，送院後發現腦部腫脹且出現腦炎，病程快速，幾乎都在3天內惡化，讓家長憂心忡忡。 這種病況目前也只有在台灣、香港出現。 由於沒有其他國家經驗，醫界在5月21日舉辦「 兒童新冠肺炎併發急性腦炎之臨床處置與案例討論 」，針對已發生的腦炎案例分析其病徵與處置過程，緊急訂出治療指引。 由於病程進展很快，家長第一時間的處理也很關鍵。 《報導者》採訪病毒專家、感染科醫師、兒童重症照護醫師等，整理Omicron兒童腦炎的6大問題，提供家長實用建議。 （最後更新時間：2022年6月6日） Q1：Omicron為何獨獨對台灣、香港兒童造成腦炎現象？
2022年5月4日 · Omicron傳染速度很快，但全世界包括台灣，接種2劑到3劑疫苗的成人比率都很高，一來病毒傳播開，已經無法「清除」；二來很多人因為打疫苗，體內有了抗體保護。 大家準備進入「與病毒共存」時代。 與病毒共存，對兒童有什麼影響？ 又要怎麼應對？ 這一系列的專題報導，有很多專家為你解答病毒和疫苗的知識，還有染病小朋友的心聲，以及與病毒作戰人的故事： 一、疫苗提醒聯絡簿. 台大醫學系黃韻如教授、台大小兒部蔡宜蓉醫師為大家完成了聯絡簿，裡面有12個你會關心的問題。 律師吳俊達也告訴你，疫苗同意書該和什麼人討論？ 要怎麼做決策？ 二、感染者的心聲. 你有同學或家人確診了嗎？ 感染COVID-19究竟是什麼樣的感受？ 10歲的Renee才剛剛經歷過這樣的風暴，她大方和大家分享她身體的變化，還有感染後的心得。
