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2021年7月8日 · 為因應衛生福利部桃園醫院醫護人員群聚感染事件，指揮中心首次在桃園醫院成立前進指揮所，由醫療應變組副組長王必勝醫師擔任指揮官，正式啟動防治作為 [5] 。 1月13日，因國際疫情仍嚴峻，全球旅遊疫情建議維持第三級，台灣人應避免所有非必要的出國旅遊 [6] 。 1月15日，加強入境者之居家檢疫措施，入境旅客除須依原規定檢附登機前3日內檢驗報告外，亦須提供檢疫居所證明（以集中檢疫或防疫旅宿為原則，若選擇居家檢疫者，則須1人1戶且經切結）。 入境檢疫措施將視疫情及執行狀況，適時滾動調整 [7] 。 1月20日，因應台灣醫院發生COVID-19疫情，即日起強化醫療院所門禁管制措施 [8] 。
2023年4月25日 · 中央流行疫情指揮中心今 (25)日表示，鑒於COVID-19疾病嚴重度下降，國內疫情持續穩定且處於低點，且國際間亦朝向調降防疫等級，故宣布自5月1日起，「嚴重特殊傳染性肺炎 (COVID-19)」調整為第四類傳染病。 另，考量中央各部會及地方政府於指揮中心運作期間已強化聯繫合作與應變能力，經盤點國內醫療量能及防疫物資儲備情形，綜合評估疫情發展及病毒變異株變化趨勢，行政院同意指揮中心於同日一併解編，由衛福部成立跨單位防治聯繫會報持續COVID-19整備應變工作。 指揮中心說明，5月1日防疫降階後，調整措施及工作重點如下： 一、 多元監測疫情，每週主動說明：疾管署持續以多元管道監測國內外疫情及變異株流行趨勢，於每週例行記者會向國人報告。
2022年1月28日 · 這階段在2022年間，先後發生「 防疫旅館 、 醫院 」、 桃機 、 高雄港 等地分別發生 Omicron變異株 （BA.1及BA.2）的本土群聚感染事件，均受到「境外移入」感染者影響，進而形成本土大規模感染，導致疫情加劇。 1月1日，台灣無新增本土病例及死亡病例 [1] 。 1月2日，台灣無新增本土病例（校正後為1例）及死亡病例 [2] 。 1月3日，台灣無新增本土病例及死亡病例，並公布2021年12月29日經校正回歸新增本土確診2例（案17058、17099） [3] 。 1月4日，台灣本土確診病例單日新增4例 [4] [5] 。 1月5日，台灣本土確診病例單日新增1例。 並公布1月2日經校正回歸新增本土確診1例（案17181） [6] 。 1月6日，台灣本土確診病例單日新增3例。
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疾管署公布日 國際累計確診數 臺灣累計確診數 COVID-19 疫情發展圖 2020/1/1 2020/7/1 2021/1/1 2021/7/1 2022/1/1 2022/7/1 2023/1/1 0 200,000,000 400,000,000 600,000,000 800,000,000 1,000,000,000 0 4,000,000 8,000,000 12,000,000 16,000,000 20,000,000 臺灣累計確診數 國際累計確診數. 數據資料最後更新時間 ...
自2023年3月20日起調整病例定義，符合臨床條件及檢驗條件之併發症(中重症)個案始須通報。考量COVID-19疾病嚴重度下降，國內疫情穩定可控，且國際間亦朝向調降防疫等級，於2023年5月1日起 「嚴重特殊傳染性肺炎(COVID-19)」由第五類傳染病調整為第四類
2020年2月26日 · 嚴重特殊傳染性肺炎臺灣疫情 是指在 中華民國 發生的 嚴重特殊傳染性肺炎 （COVID-19） 疫情 。 自2020年1月21日至2023年3月20日止，臺灣 累計確診病例 10,236,886例 （10,178,478例本土案例、58,354例境外移入案例、36例敦睦艦隊、3例航空器感染、1例不明及14例調查中），確診率為44.15%，累計 死亡病例18,803例 （18,779例本土案例、24例境外移入案例），致死率 0.18%，另確診個案中12,190例移除為空號。 自2023年3月20日至2023年5月27日止，臺灣 累計併發症病例 8,454例 （25例境外移入案例、其餘為本土病例）。 病例分布以新北市最多1,563例，其次為臺北市957例。 連江縣無併發症病例。
