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指揮中心指出，COVID-19 公費疫苗預約平台第十輪開放預約接種第二劑疫苗，包括 9 月 30 日 (含) 前符合已接種 AZ 疫苗第一劑且間隔滿 10 週以上的 64 至 50 歲民眾，以及 10 月 6 日 (含) 前符合已接種高端疫苗第一劑且間隔滿 4 週以上的民眾。
2021年9月16日 · 台北市長柯文哲今 (16) 日拋出類似疫苗護照概念的「健康通行證」，他指出，打完 2 劑新冠疫苗的民眾，會顯示綠色，將可鬆綁防疫規範，打過 1 劑疫苗顯示為黃燈，未接種疫苗者為紅燈，只要中央點頭，北市就可以馬上發布。
2021年7月23日 · 依照日本政府規劃的輝瑞疫苗交貨日期， 2021 年 6 月前將取得 1 億劑，7 到 9 月取得 7000 萬劑，10 到 11 月取得 2000 萬劑。 不過日本部分行政區進入 7 月之後面臨疫苗供應減少的問題，導致疫苗接種預約中斷。
2021年11月15日 · 高端指出，疫情指揮中心開放混打政策，讓已接種高端疫苗民眾在短期內需出國者，可混打其他疫苗；暫無急迫出國需求者，可持續追蹤高端疫苗國際認證進度。
指揮中心表示，5 月 1 日防疫降階後，疾管署仍持續以多元管道監測國內外疫情及變異株流行趨勢，於每週例行記者會向國人報告；同時，持續儲備及提供各年齡層公費 COVID-19 疫苗接種，不過，醫療院所施打疫苗可恢復收取掛號費。
2021年8月17日 · 輝瑞 (PFE-US) 與 BioNTech(BNTX-US) 周一（16 日）表示，已向美國食品藥品監督管理局（FDA）呈交一份早期臨床試驗數據，以針對 16 歲以上民眾申請第三劑新冠疫苗施打授權，並認為不只有免疫力低下的人需要施打第三劑疫苗。
指揮中心宣布，第六輪新冠疫苗接種作業將提供 60 萬劑高端疫苗，目前共有 35 萬劑高端疫苗通過食藥署檢驗封緘，後續若持續有疫苗完成檢驗封緘，不排除再增加疫苗數。
