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2022年1月28日 · 這階段在2022年間，先後發生「 防疫旅館 、 醫院 」、 桃機 、 高雄港 等地分別發生 Omicron變異株 （BA.1及BA.2）的本土群聚感染事件，均受到「境外移入」感染者影響，進而形成本土大規模感染，導致疫情加劇。. 1月1日，台灣無新增本土病例及死亡病例 [ 1] 。. 1 ...
5月14日，指揮中心宣布，為降低「COVID-19」感染後中、重症風險，5月16日起開放部分對象接種「第一次追加劑」滿5個月後，可接種「第二次追加劑」，開放對象：65歲以上長者、長照機構住民、18歲以上免疫不全及免疫力低下且病情穩定者(即建議接種基礎
2021年7月8日 · 臺北市、新北市即日起至5月28日（共計2週）提升防疫警戒至第三級，其他縣市依舊維持二級，同時避免二、三級區域之間不必要的移動 [42] [43]。
第二級疫情警戒 （2021年7月27日－2022年2月28日） 這階段在2022年間，先後發生「防疫旅館 、 醫院」、 桃機 、 高雄港 等地分別發生 Omicron變異株 （BA.1及BA.2）的本土群聚感染事件，均受到「境外移入」感染者影響，進而形成本土大規模感染，導致疫情加劇。 1月1日，台灣無新增本土病例及死亡病例 [1]。 1月2日，台灣無新增本土病例（校正後為1例）及死亡病例 [2]。 1月3日，台灣無新增本土病例及死亡病例，並公布2021年12月29日經校正回歸新增本土確診2例（案17058、17099） [3]。 1月4日，台灣本土確診病例單日新增4例 [4][5]。 1月5日，台灣本土確診病例單日新增1例。 並公布1月2日經校正回歸新增本土確診1例（案17181） [6]。
3月17日，中央流行疫情指揮中心將全球各國（除第二、三級國家與地區之外）的旅遊疫情警示升為第一級（一級 一般措施）；歐洲四十國、中東十六國與一地區、北非五國及中亞九國 [註 8] 的旅遊疫情警示升為第三級（三級 不宜前往）。
2020年3月13日 · 在歐洲中部時間1月30日舉行第三次緊急委員會會議後，世界衛生組織正式宣布該次疫情構成國際公共衛生緊急事件，使嚴重特殊傳染性肺炎疫情成為有史以來第6例國際關注公共衛生緊急事件 [11]。
2020年2月26日 · 自即日起未曾接種基礎劑第1劑者，請接種「Moderna」（單價疫苗），接種單位將不再提供(含預約作業)第1劑接種「Pfizer-BioNTech疫苗」；二、「滿5歲至未滿12歲」（兒童）基礎劑需以同廠牌疫苗接種，兩劑接種間隔4週以上。
