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變種病毒 Omicron 持續在全球擴散，為了因應農曆春節返鄉人潮，疫情指揮中心指揮官陳時中今 (2) 日宣布，已完整接種 COVID-19 疫苗且滿 5 個月的民眾，即日起可追加施打第三劑，目前僅供莫德納疫苗，約有 4.8 萬人符合資格，多為醫護、第一線高感染風險
2021年7月19日 · 台北市長柯文哲考慮舉債 40 億元自購第 3 劑新冠肺炎疫苗，對此，指揮中心指揮官陳時中今 (19) 日表示，此想法與中央一樣，各國明年都需要次世代疫苗，都在準備中，台灣採購次世代疫苗的談判，也進入最後階段。
中央流行疫情指揮中心今 (8) 日表示，測試大廠京元電 (2449-TW) 累計確診人數共達 210 名，外國籍、本國籍確診人數分別為 170、40 名，公司為防堵疫情，也決定啟動二次快篩，外籍移工將在明日進行，本國籍則預定本周五、六進行。
指揮中心宣布，第六輪新冠疫苗接種作業將提供 60 萬劑高端疫苗，目前共有 35 萬劑高端疫苗通過食藥署檢驗封緘，後續若持續有疫苗完成檢驗封緘，不排除再增加疫苗數。
2022年1月26日 · 陳時中表示，依據採檢結果，指揮中心決定亞旭必須持續停工，員工須定期進行快篩，至於加值園區其餘公司，只要在前進指揮所審視大樓分流、共餐及是否可落實自主健康管理監測情況後，即可陸續恢復營運。 (中央流行疫情指揮中心提供)
2021年11月29日 · 新型變異株 Omicron 擴散多國，指揮中心今 (29) 日宣布，12 月 1 日零時起，將馬拉威、莫三比克、埃及、奈及利亞納入重點高風險國家，入境後須入住集中檢疫所；隨著疫苗涵蓋率上升，ACIP 專家會議討論後，建議 12-17 歲青少年接種第二劑 BNT 疫苗，此外
2021年9月16日 · 台北市長柯文哲今 (16) 日拋出類似疫苗護照概念的「健康通行證」，他指出，打完 2 劑新冠疫苗的民眾，會顯示綠色，將可鬆綁防疫規範，打過 1 劑疫苗顯示為黃燈，未接種疫苗者為紅燈，只要中央點頭，北市就可以馬上發布。
