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WHO宣布M痘疫情為國際公共衛生緊急事件，籲請醫師提高警覺，加強對疑似病例通報，並協助或轉介符合疫苗接種條件民眾接種疫苗，維護國人健康(疾病管制署致醫界通函第546號)
（一）2020年1月20日報請行政院核准成立「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」並以三級開設。 （二） 2020年1月23日由行政院蘇院長貞昌宣布提升為二級開設。
2023年4月25日 · 中央流行疫情指揮中心今 (25)日表示，鑒於COVID-19疾病嚴重度下降，國內疫情持續穩定且處於低點，且國際間亦朝向調降防疫等級，故宣布自5月1日起，「嚴重特殊傳染性肺炎 (COVID-19)」調整為第四類傳染病。. 另，考量中央各部會及地方政府於指揮中心運作期間已 ...
2020年1月5日 · 國際間COVID-19病毒變異株疫情持續，且國內疫情處上升階段，指揮中心呼籲，尚未接種Moderna雙價BA.4/5次世代疫苗者前往接種，提升免疫保護力 2022/12/29 2023年1月1日起，不具健保身分之非本國籍人士在臺期間確診COVID-19，需自付確診隔離治療費用
嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心（簡稱疫情指揮中心，英語： Central Epidemic Command Center，縮寫CECC ）是中華民國（臺灣）因應嚴重特殊傳染性肺炎（Covid-19）疫情而於2020年1月20日至2023年5月1日開設的中央疫情指揮中心。
2020年1月20日，因應國際已有多起 嚴重特殊傳染性肺炎 案例，國家衛生指揮中心針對該疾病開設「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」，由疾管署署長 周志浩 擔任指揮官。 1月23日， 行政院 將該指揮中心提升為二級開設，指揮官改由時任衛生福利部部長 陳時中 擔任，副指揮官由時任內政部政務次長 陳宗彥 擔任。 2月27日，行政院將該指揮中心再提升為一級開設 [1]，指揮官繼續由時任衛生福利部部長 陳時中 擔任。 2020年3月9日，增設副指揮官並調整內部組織運作 [2]。 4月15日，增設法務組。 6月7日，疫情記者會從每天舉辦改為一週一次，訂於每週三下午2時舉行 [3]。 2021年1月12日，因應 部桃群聚感染事件，重啟每日記者會。
自3月20日起，COVID-19輕症免通報免隔離，快篩陽性輕症民眾如出現重症警示症狀請立即就醫，確診高風險民眾符合條件仍可開立口服抗病毒藥物. 3月27日起取消住宿式身心障礙福利機構、兒少安置機構、兒少團體家庭照顧機構定期快篩措施，其餘住宿式照顧機構 ...
