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2022年1月28日 · 這階段在2022年間，先後發生「防疫旅館、醫院」、桃機、高雄港等地分別發生Omicron變異株（BA.1及BA.2）的本土群聚感染事件，均受到「境外移入」感染者影響，進而形成本土大規模感染，導致疫情加劇。
2021年7月8日 · 5月16日，台灣本土確診病例單日新增206例（校正後為284例），為因應近期台灣本土疫情升溫，為利傳染病防治工作進行，指揮中心也授權各直轄市、縣（市）政府以「指揮中心記者會確診個案資料發布原則」，發布確診個案公共場所活動史 [64]。
2021年中華民國全國疫情第三級警戒 ，簡稱 2021年全臺三級警戒 ，是 中華民國 在2021年因應 嚴重特殊傳染性肺炎疫情 的管制措施。 5月15日，中華民國 行政院 臨時召開記者會， 行政院院長 蘇貞昌 、 衛生福利部 部長兼 中央流行疫情指揮中心 指揮官 陳時中 、 內政部部長 徐國勇 、 經濟部部長 王美花 、 行政院發言人 羅秉成 共同宣布， 臺北都會區 （ 臺北市 、 新北市 ）提升疫情警戒至 第三級 至5月28日。 5月19日，中央流行疫情指揮中心宣佈，因臺灣本土疫情持續嚴峻，將第三級防疫警戒範圍擴大至全國、至5月28日 [1] [2] 。 5月25日，中央流行疫情指揮中心宣布，全國第三級警戒首次延長至6月14日 [3] 。
專家建議，除目前已實施的登機檢疫外，醫療院所注意從武漢抵台之臨床嚴重肺炎病人及加強通報，並提醒醫護人員嚴格執行標準感染防護措施；進行插管、氣切等侵入式醫療行為時應依規定佩戴N95口罩 [16] 。 1月7日，疾管署將武汉市的旅遊疫情建議列為第一級 [17] ，同時對國際航線及 小三通 提升警戒 [18] 。 1月12日，疾管署派出 莊銀清 、 洪敏南 2名專家抵達武漢查訪 [19] ，實地交流並瞭解了防治的相關資訊，於15日返回 [20] [21] [22] 。 1月15日，疾管署公告將「嚴重特殊傳染性肺炎」列入第五類 法定傳染病 [1] 。 1月16日，疾管署宣布提升中國湖北省武漢市的旅遊疫情建議至第二級警示，提醒民众近期如前往武漢及鄰近區域，應該做好個人防護的措施 [23] 。
嚴重特殊傳染性肺炎臺灣疫情 是指在 中華民國 發生的 嚴重特殊傳染性肺炎 （COVID-19） 疫情 。 自2020年1月21日至2023年3月20日止，臺灣 累計確診病例 10,236,886例 （10,178,478例本土案例、58,354例境外移入案例、36例敦睦艦隊、3例航空器感染、1例不明及14例調查中），確診率為44.15%，累計 死亡病例18,803例 （18,779例本土案例、24例境外移入案例），致死率 0.18%，另確診個案中12,190例移除為空號。 自2023年3月20日至2023年5月27日止，臺灣 累計併發症病例 8,454例 （25例境外移入案例、其餘為本土病例）。 病例分布以新北市最多1,563例，其次為臺北市957例。 連江縣無併發症病例。
臺中市： 臺中捷運（綠線）： 5月13日（週四），受本土疫情影響，中捷綠線同日運量為18,948人次（較前一週同期〈25,012人次〉下滑約24.52％） [49]。14日（週五），中捷綠線同日運量為24,085人次 [50]。15日（週六），中捷 綠線同日運量為12,849人次。
2020年2月26日 · 嚴重特殊傳染性肺炎臺灣疫情 是指在 中華民國 發生的 嚴重特殊傳染性肺炎 （COVID-19） 疫情 。 自2020年1月21日至2023年3月20日止，臺灣 累計確診病例 10,236,886例 （10,178,478例本土案例、58,354例境外移入案例、36例敦睦艦隊、3例航空器感染、1例不明及14例調查中），確診率為44.15%，累計 死亡病例18,803例 （18,779例本土案例、24例境外移入案例），致死率 0.18%，另確診個案中12,190例移除為空號。 自2023年3月20日至2023年5月27日止，臺灣 累計併發症病例 8,454例 （25例境外移入案例、其餘為本土病例）。 病例分布以新北市最多1,563例，其次為臺北市957例。 連江縣無併發症病例。
