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2021年1月21日，疾管署針對境外移入「嚴重特殊傳染性肺炎」事件對台灣疫情影響，特訂定此公告《疫情警戒標準及因應事項》，並於2月4日製作單張宣導單予以發布，以加強台灣人對此疫情事件之重視（指揮中心將視疫情狀況，適時參酌採行） [2]。
行政院院長 蘇貞昌. 時任總統府秘書長 陳菊. 1月23日，中央流行疫情指揮中心宣布將中心由三級提升至二級，由 衛生福利部 部長 陳時中 擔任指揮官 [32] 。 原本只針對武漢人士的邊境檢疫擴大到所有中國大陸入境者，並拒絕居住於湖北省武漢市的居民登機入境，入境旅客必須詳實填寫行蹤記錄與健康狀況聲明書 [33] ；隔日中央流行疫情中心宣布，為確保當地的口罩供應充足，自1月24日起管制N95口罩及外科口罩出口一個月 [34] [35] ，並要求25日凌晨零點開始到該月底，全面暫停旅行團前往中國大陸旅遊 [36] 。 蘇貞昌院長指示衛福部持續落實邊境檢疫應變措施，加強入境旅客發燒篩檢，強化相關防疫措施 [37] 。
2021年1月21日，疾管署針對境外移入「嚴重特殊傳染性肺炎」事件對台灣疫情影響，特訂定此公告《疫情警戒標準及因應事項》，並於2月4日製作單張宣導單予以發布，以加強台灣人對此疫情事件之重視（指揮中心將視疫情狀況，適時參酌採行） [2]。
2020年2月26日 · 3月17日，大量民眾自西方國家返回臺灣，境外移入的案例陸續增加 [64]，防疫工作與人力上的壓力陡增 [65]。 此時防疫策略集中在強制檢疫隔離、防堵病毒擴散、加強醫護專業治療，直到封鎖邊境及加強入境檢疫後，境外移入案例的壓力才減輕 [66]。
2021年7月8日 · 接觸者須先採取居家隔離措施，並同時評估個案感染情形及傳染力。 接觸者於居家隔離期間，若指標病例達解除隔離條件並解除隔離，經評估接觸時無傳染力，則接觸者可同時解除居家隔離，並改為自主健康管理至14天期滿。
1月21日台灣的首例嚴重特殊傳染性肺炎確診後，疾管署提升中國湖北省武漢市旅遊疫情建議至第三級警告，提醒如非必要應避免前往當地 [26] ；大陸委員會也依指揮中心決定，同步調升武漢的旅遊警示燈為「橙色」，建議民眾避免非必要前往旅行 [27] ；同日 行政院 院長 蘇貞昌 表示政府嚴陣以待，境內備有約4400萬個 外科口罩 ，並備有約193萬個 N95口罩 ；隔日 交通部觀光局 停止旅行業出團至湖北旅遊，也停止接湖北的旅遊團。 交通部 部長 林佳龍 指示，23日至29日共10個武漢赴台旅遊團也協調取消 [28] ；為配合防疫政策， 內政部移民署 在同日晚間已針對觀光局所提供擬於1月底赴台的武漢團24團429人辦理廢證，且即日起暫停核發武漢旅遊團的入境許可 [29] 。
嚴重特殊傳染性肺炎臺灣疫情 是指在 中華民國 發生的 嚴重特殊傳染性肺炎 （COVID-19） 疫情 。 自2020年1月21日至2023年3月20日止，臺灣 累計確診病例 10,236,886例 （10,178,478例本土案例、58,354例境外移入案例、36例敦睦艦隊、3例航空器感染、1例不明及14例調查中），確診率為44.15%，累計 死亡病例18,803例 （18,779例本土案例、24例境外移入案例），致死率 0.18%，另確診個案中12,190例移除為空號。 自2023年3月20日至2023年5月27日止，臺灣 累計併發症病例 8,454例 （25例境外移入案例、其餘為本土病例）。 病例分布以新北市最多1,563例，其次為臺北市957例。 連江縣無併發症病例。
