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特性要因図（とくせいよういんず）は、1956年に石川馨 [1] が考案した、特性と要因の関係を系統的に線で結んで（樹状に）表した図をいう。魚の骨図（フィッシュボーン・チャート、fishbone diagram）、Ishikawa diagramとも呼ばれる [2]。
最尤推定 （さいゆうすいてい、 英 : maximum likelihood estimation という）や 最尤法 （さいゆうほう、 英 : method of maximum likelihood ）とは、 統計学 において、与えられたデータからそれが従う 確率分布 の 母数 を 点推定 する方法である。 この方法は ロナルド・フィッシャー が 1912年 から 1922年 にかけて開発した。 観測されたデータからそれを生んだ母集団を説明しようとする際に広く用いられる。 生物学では 塩基 や アミノ酸 配列のような分子データの置換に関する確率モデルに基づいて 系統樹 を作成する際に、一番尤もらしくデータを説明する樹形を選択するための有力な方法としても利用される。
非加重結合法 （Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean、 UPGMA と略す）は 系統樹 を作製するためのボトムアップ式の クラスタ解析 法である。 入力データは対象の各ペア間の 距離 であり、有根系統樹が作製される。 進化速度が一定（ 分子時計 仮説）と仮定して有根系統樹を作成する際に用いられる [1] 。 原理. 非加重結合法は 距離行列 を用いた系統推定法である 距離行列法 の一つであり、総枝長が最短となる樹形が最適樹であると考える最小進化原理に基づいている [2] 。 非加重結合法では、まず各対象がそれぞれ1つのクラスタを作っているとする。
分子系統学の研究は、20世紀半ばに ポーリング らにより分子進化（生物種によるアミノ酸配列の違いが過去の進化を反映していると考える）が研究され、 分子時計 仮説が提唱されたのに始まる。 分子進化がほぼ一定の速度で進むとする考えで、進化の時間経過が追えることが示唆された。 その後分子進化速度は機能的に重要でない部分は早く進化するなど一定ではないことが明らかになり、 木村資生 による 中立進化説 が定説となった。 分子系統学はこれらの理論に基本を置いている。 方法. 配列情報に基づく系統解析の方法として当初用いられたのは、計算方法が比較的単純であったこともあり、距離行列法の一種で進化速度が一定であることを仮定する 非加重結合法 であった。
学問の一覧（がくもんのいちらん）は、大学・大学院レベルで学ばれる学問分野を分類したものである。 それぞれの分野には下位分野があり「（例）物理学→素粒子物理学」、これらにはそれぞれ学術雑誌、学会があることが多い。 学問の分類には図書分類法のような分類法がなく、日本と ...
システマティック・レビュー （ 英語: systematic review ）または 系統的レビュー とは、文献をくまなく調査し、 ランダム化比較試験 （RCT）のような質の高い研究のデータを、 出版バイアス のようなデータの偏りを限りなく除き、分析を行うことである [2] 。 根拠に基づく医療 （EBM）で用いるための情報の収集と、吟味の部分を担う調査である [3] 。 世界大学ランキングで5位にランクされているカロリンスカ研究所 [4] によると、系統的レビューは研究者と博士課程向けであり、構造的文献レビューは修士と大学向けである。 系統的レビューは2人以上で取り組む必要があるため、1人だと構造化文献レビューや系統的文献レビューを行うしかない [5] 。
分岐ツリー図 分岐学（ぶんきがく、英語: cladistics ）とは、系統学の手法のひとつ。 分岐論、あるいは分類学のひとつの方法あるいは立場として分岐分類学ともいう。 分岐学は、ドイツの昆虫学者 ヴィリー・ヘニッヒ（Willi Hennig）により、1950年に提唱された。
