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1月7日，疾管署將武汉市的旅遊疫情建議列為第一級 [17]，同時對國際航線及小三通提升警戒 [18]。 1月12日，疾管署派出 莊銀清 、 洪敏南 2名專家抵達武漢查訪 [19] ，實地交流並瞭解了防治的相關資訊，於15日返回 [20] [21] [22] 。
2020年1月20日，衛生福利部成立「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」。 2020年4月6日，中央流行疫情指揮中心訂定〈「COVID‐19（武漢肺炎）」阻絕社區傳染策略〉，將境外移入後之社區感染管制階段分為「第一級 過渡期」、「第二級 警戒期」、「第三級 管制期」 [14] 。 2021年1月21日，中央疫情指揮中心針對境外移入後之本土疫情訂定公告《疫情警戒標準及因應事項》，將疫情警戒狀態分為分為第一、二、三、四級，數字愈高管制措施愈嚴格 [15] 。 5月，由於爆發 萬華茶藝館衍生感染事件 以致陸續提升疫情警戒（已知相關案例之發病日至遲可溯及4月23日 [16] [17] ）。
- 衛生福利部疾病管制署. } 嚴重特殊傳染性肺炎. Line 列印. 衛生福利部中華民國 109 年 1 月 15 日衛授疾字第 1090100030 號公告，新增「嚴重特殊傳染性肺炎」為第五類法定傳染病。 2019年12月以來，湖北省武漢市展開呼吸道疾病及相關疾病監測，發現不明原因病毒性肺炎病例。 個案臨床表現主要為發熱，少數病人呼吸困難，胸部X光片呈雙肺浸潤性病灶。 2020年1月9日接獲中國大陸通知，病原體初步判定為新型冠狀病毒，已完成病毒全長基因定序，電子顯微鏡下亦呈典型冠狀病毒型態，該病毒不同於以往發現的人類冠狀病毒。 冠狀病毒 (CoV)為一群有外套膜之RNA病毒，外表為圓形，在電子顯微鏡下可看到類似皇冠的突起因此得名。
2021年5月19日 · 〔即時新聞／綜合報導〕中央疫情指揮中心19日公布武漢肺炎（新型冠狀病毒病，COVID-19）本土病例新增267例，5天內案例破千，即起全國提升至三級 ...
專家建議，除目前已實施的登機檢疫外，醫療院所注意從武漢抵台之臨床嚴重肺炎病人及加強通報，並提醒醫護人員嚴格執行標準感染防護措施；進行插管、氣切等侵入式醫療行為時應依規定佩戴N95口罩 [16] 。 1月7日，疾管署將武漢市的旅遊疫情建議列為第一級 [17] ，同時對國際航線及 小三通 提升警戒 [18] 。 1月12日，疾管署派出 莊銀清 、 洪敏南 2名專家抵達武漢查訪 [19] ，實地交流並瞭解了防治的相關資訊，於15日返回 [20] [21] [22] 。 1月15日，疾管署公告將「嚴重特殊傳染性肺炎」列入第五類 法定傳染病 [1] 。 1月16日，疾管署宣布提升中國湖北省武漢市的旅遊疫情建議至第二級警示，提醒民眾近期如前往武漢及鄰近區域，應該做好個人防護的措施 [23] 。
臺灣嚴重特殊傳染性肺炎(COVID 19)防疫關鍵決策網
2021年5月19日 · （中央社記者陳婕翎、江慧珺台北19日電）國內武漢肺炎（2019冠狀病毒疾病，COVID-19）疫情擴大，指揮中心指揮官陳時中今天宣布，全國疫情警戒升至第三級至28日，從明天起每天舉行全國防疫會議，整合防疫資源。 陳時中今天下午記者會說明，各縣市確診個案持續增加，全國防疫需齊一腳步，齊心抗疫，確保全國各類防疫標準保持一致，從明天起每天舉行全國防疫會議，整合防疫資源，檢視執行防疫進度，駁斥假訊息。 陳時中說，明天開始每天上午會邀集各地副縣市長層級以上長官，由中央疫情指揮中心副指揮官陳宗彥及衛福部次長石崇良主持，舉行全國防疫會議，以整合防疫資源、檢視執行進度、駁斥假訊息作為三大任務。
