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2020年2月26日 · 11月7日，確診者隔離改為「7+n(n=0~7)」；取消居家隔離及防疫補償。公共場所不再強制量體溫。另外確診者的接觸者取消已實施超過1000天的居家隔離。 11月10日，首批莫德納-雙價次世代疫苗（原型株+Omicron BA.4/BA.5變異株）到貨 [222]。
2021年7月8日 · 5月25日，台灣本土確診病例單日新增281例（校正後為499例），確診病例新增6例死亡，並公布5月16日至24日經校正回歸新增本土確診261例 [86]，不但本土確診人數向上突破4,000例、校正回歸累計突破1,000例，而且全台19個縣市失守，包括台灣6個直轄市（6
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敦睦遠航訓練支隊於2020年2月20日編隊，由磐石號油彈補給艦擔任旗艦，納編成功級岳飛號巡防艦、康定級康定號巡防艦，3月5日從左營軍港出發，並在12日抵達帛琉共和國，因該國港口限制，由康定艦代表進港；這是該隊第15次訪問帛琉，於3月15日離開帛琉，受疫情影響，只訪問帛琉，於4月9日返回左營軍港，並在船上檢疫六天，於4月15日放行下船，不過放行前一日就開放官兵下船，並有些官兵開始休假。
2020年4月18日，中央流行疫情指揮中心確認船上的3名實習官兵感染嚴重特殊傳染性肺炎，其中個案396在4月12日出現頭痛和嗅覺異常情況，下船後立即就醫；個案397在4月初出現呼吸道腫痛、頭痛、流鼻水、咳嗽、嗅覺異常情況，於4月17日就醫；個案398在4月13日出現嗅覺異常情況，也於17日就醫；隨後中華民國國防部緊急召回700名官兵，並全數進行採檢，並於隔日增加21名官兵確診，當時累積達到24名官兵確診，皆在磐石號油彈補給艦，相隔一天後，中央流行疫情指揮中心在於4月21日，公布新增3名官兵確診，之後四日每日皆增加1名官兵確診；5月3日4例；5月4日1例，確診累積達到36名，尚未有其他接觸者確診。
最初中央疫情指揮中心判斷感染源來自帛琉共和國，但該國截至4月18日止仍無任一確診病例產生。故未排除有境內感染的可能性，由於3月15日離開帛琉已經一段時間，最初確診的3名未必是第一波感染者，可能需要驗抗體才能確認感染源，由於暫時無法確認境內外感染，中央疫情指揮中心獨立出一個專案，以避免爭議；同時帛琉共和國政府也採檢500名接觸者，新光醫院捐助予帛琉興建的實驗室在4月15日落成，立即投入檢驗，隨後中央流行疫情指揮中心在20日說明有3名官兵驗出抗體，證明最初確診的3名並非第一波感染者，船艦經過消毒後，調查人員實施清查，發現磐石軍艦有148名官兵有艦上看診紀錄，共計226人次，其中有5名官兵有發燒紀錄，隨後病例和醫療紀錄移交予中央疫情指揮中心，而3人驗出抗體的官兵皆有發燒紀錄，有發燒紀錄且驗出抗體的...
在3名官兵確診後，使高雄市政府環境保護局和高雄市政府衛生局派出清潔人員及衛生人員前往海軍左營基地門口加強消毒；由於軍隊染疫，國防部已下令要求所有軍人全日戴口罩，國防大學政治作戰學院有敦睦遠航訓練支隊學生，國防部進行全校消毒，並停課兩個星期，漢光演習被延到九月，全國軍人教育召集也被延緩。由於敦睦遠航訓練支隊官兵在15日下船後未隔離，導致至少數千人暴露感染危機，引發臺灣本島疫情面臨危機，為防堵惡化，中央疫情指揮中心通知與敦睦遠航訓練支隊官兵的接觸者，須自主健康管理，隨後各地政府公告確診者足跡後，便針對到過確診者停留場所人士超過15分鐘以上地點，發出簡訊告知須自主健康管理；由於確診官兵到過漢神巨蛋、瑞豐夜市、義大世界購物廣場、家樂福鼎山店、好市多大順店、四維羽球場、小港郵局，高雄市政府在19日下午...
由於官兵下船後未居家隔離14天，被質疑為防疫破口，確診者在軍艦上反應身體不適，但國防部卻以一般症狀處理，被部分立法委員批評應變太慢，海軍艦隊在全球疫情蔓延下執意出航，且未通報中央流行疫情指揮中心，立法院外交及國防委員會召集委員指出，嚴重特殊傳染性肺炎不一定發燒，但軍方僅以量測體溫作為篩檢方式，有需要重新檢討；另外，在接獲實習生反映有頭痛、嗅覺異常症狀，但軍方完全沒有處理；另外國防部副部長張哲平上將表示行程中均有配戴口罩，但駐帛琉大使臉書貼文訊息的影片中，官兵並未戴口罩，也沒有保持一公尺的社交距離，4月19日下午國防部海軍司令部副司令梅家樹中將在記者會上鞠躬道歉，表示確實參訪帛琉共和國時沒戴口罩，並且全程沒有做好防疫工作，造成群聚感染，將調查責任歸屬；另外，最初國防部海軍司令部聲稱4月15日才...
嚴重特殊傳染性肺炎美國海軍西奧多·羅斯福號航空母艦疫情（英語：2020_coronavirus_pandemic_on_USS_Theodore_Roosevelt）嚴重特殊傳染性肺炎法國海軍戴高樂號航空母艦疫情（英語：2020_coronavirus_pandemic_on_Charles_de_Gaulle）5月11日，臺灣總確診數突破50萬例。. 5月12日，正式實施修訂「 2019年冠狀病毒病 」定義，新增「居家隔離」及「自主防疫」或「居家檢疫」期間使用「家用快篩」檢測陽性，經醫事人員確認為確診條件 [183] [184] 。. 5月13日，臺灣總死亡人數突破1,000例。. 5月14日 ...
於20日停業消毒一天 [39]，之後瑞豐夜市宣布停業到4月22日，以便衛生局作完整疫調 [40]，臺南市新光三越台南新天地也有確診官兵進入，因此臺南市政府立即下令封館消毒一天 [41]；隨後中央流行疫情指揮中心在4月20日下午公布確診官兵的活動足跡地圖 ...
- 2020年4月18日
- 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2
2022年1月28日 · 6月10日，台灣本土確診病例單日新增68,311例，確診個案新增213例死亡，創新增死亡史上新高。 6月11日，台灣本土確診病例單日新增79,598例，確診個案新增211例死亡。
5月20日，台灣本土確診病例單日新增286例（校正後為474例），確診病例新增1例死亡，10天內全台爆1,500餘例本土病例，由於疫情嚴峻，中央流行疫情中心指揮官陳時中與醫療應變組副組長羅一鈞在記者會上說明，關於企業購買快篩試劑使用，會在專家會議上
